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丢掉了首都的张胜裕虽然成功地逃脱，但是失去了他大部分的势力，只能龟缩在海岛上苟延残喘。青帮的佟世继判断他不再是主要的敌人，另外一个造反起家的李自成，才是青帮的主要敌人。
于是，青帮集结军队，开始追击李自成。
这时候的李自成，沿着长江往上游逃窜。他的情况很糟糕，失败主义犹如瘟疫一般传染了整支军队，部下在不断地溃散，只有少部分的忠心部下才聚集在身边。对于这点，李自成产生了强烈的即视感，仿佛回到了从前，那时候他经常遭到明军的攻击，有时候落败，几乎都是只身逃亡。为什么会这样呢？他开始意识到，成为王者，首先并不是仁慈，而是强势。他需要更多的军队，以及让军队能够战斗的粮食和物质。
李自成抵达了湖北，决定在此募集士兵和武术家。湖北是明朝开国皇帝张无忌的祖籍所在地，一直经营得很好，而且受到小冰河时期的影响也较小。
此刻的湖北，官僚们依旧有效地进行着统治，他们对于应天变化莫测的旗帜感到迷惑，但是基于官僚主义，决定继续听从应天的命令。现在，他们的皇帝，已经从张胜裕变成了顺治帝，无论哪个皇帝，都把李自成视为逆贼。
官僚们开始组织军队袭击李自成，统治湖北的门派武当派，也开始号召武术家，禁止他们投入李自成麾下，并且宣称要杀死李自成。
李自成嗤之以鼻，他击败过明朝的主力军队，根本没有把湖北官僚的地方军队和武当派放在眼里。
然而历史就是这么喜欢开玩笑，1645年5月17日，李自成正在视察九宫山的时候，被当地的农民意外发现。他的形象特征过于明显，身材高大，又瞎了一只眼睛，使得农民们马上认出了这是逆贼的首领，于是赶紧派人前去统治官府。
正好当地驻扎有一支武当派的小分队，他们听说了这个消息以后，偷偷地前去侦察，发现托大的李自成身边竟然没有护卫，意识到是一个很好的机会，于是发动了进攻。华山派出身的李自成武功一般，根本不是武当派高手的对手，瞬间就被击杀。但是他的部下抢走了尸体，用红布包裹着，大哭而去。
很快，所有人都收到了李自成丧命的消息，简直难以置信。毕竟李自成是推翻了一个王朝，登基称帝的男人，居然以这么屈辱的方式死掉，实在出乎意料。
顺派方面，由于李自成没有子嗣，危急之下，所有人推选李自成的侄子李过继承李自成的帝位。但是顺派受到影响，有众多的人员脱离了顺派。
得到消息的青帮马上开始组织军队向顺派进攻，他们打着为张胜文报仇的旗号，招募士兵和武术家，双方开始混战。
与此同时，逃到了舟山群岛的张胜裕，正在反省。他意识到，没有强大的实力，空有阴谋是没用的。接下来张胜裕有两条路，一条是逃回金山府，以青帮的航海能力，显然是无法追击他的。另外一条，就是继续留在大陆夺回属于他的一切。
张胜裕不想这么灰溜溜地逃回去，毕竟他是张无忌的子孙，祖先强大的血脉流淌在身体里，他可以失败，但是不能失去！
张胜裕认识到，天地会并不是一个可靠的合作对象，拥有资本家的一切弱点，贪婪而无能，他必须有可靠的组织帮助他实现愿望。
这样，张胜裕开始组建自己的组织，他成立了一个新的门派，叫做洪门。洪，是明朝开国皇帝张无忌年号的第一个字，此外是明朝代表色“红”的谐音，他用这个来命名，寓意着恢复明朝的统治。
一开始，任务是艰难的。人人都在嘲笑他这个逃出首都的皇帝，说他是一个历史的小丑。张胜裕不为所动，他打着“驱逐鞑虏”的旗号，耐心等着。因为青帮是一个蛮人的统治集团，即使有明朝皇帝的旗号，但是终究有一天会暴露野蛮人的本质。
在张胜裕积蓄力量的同时，顺派和青帮激烈地交战着。尽管顺派已经分裂了，但是实际上却对青帮造成了更大的困惑，他们不得不将军队分出多股去剿灭顺派。
顺派渐渐地落了下风，如果一切正常的话，青帮将在一至两年内，完全获得胜利。没有了顺派这个势均力敌的敌人，那么整个中国的统治权就归属于青帮了。
然而胜利在望的青帮却做出了一系列的错误举动，首先是在1646年，青帮的实际统治者佟世继因为中风去世，因为他的继承人年纪还小，青帮的高层就推举他的弟弟佟世衮（蒙古名：多尔衮）成为青帮的领袖。
和睿智而聪明的佟世继相比，佟世衮更加野蛮残暴。他公开要求统治下的所有汉人，剔去脑袋上的半边头发，梳起野蛮人的发型，并且改变他们的服饰，也穿上野蛮人的服饰。具有侮辱性的是，这条命令仅对男人有效，女人、孩子、死人、和尚、导师无需遵守这条命令。
这使得很多已经投降并臣服于青帮的汉族官僚、武术家产生了逆反心理，不断地进行抗议。佟世衮的回答是杀戮，把提出问题的人解决了，就没有问题了。
残酷的屠杀吓坏了很多人，有的人屈服了，有的人更加不满，他们突然意识到，除了青帮推出的皇帝可以效忠以外，在舟山还有一个正统的明朝皇帝，他也值得投靠。于是不少人出海跑到了舟山，去投靠张胜裕。
佟世衮对外残酷，对内也非常冷酷。他杀死了一切内部的反对。在名义上，他的亲生侄子才是皇帝，但是佟世衮将自己视为侄子的父亲一般，不仅公开地与侄子的母亲、兄长的妻子、自己的嫂嫂同居，还自称摄政王，让年轻的皇帝心中既害怕也不满。
佟世衮的统治并没有持续多久，1650年，佟世衮追随兄长，因为中风去世。他没有合法的继承人，所以权力重新归属到了前任青帮统治者佟世继的儿子，现任“明朝”皇帝的佟福临手中。年轻的皇帝早就对叔叔不满，但是敌人过于势大，不得不隐忍。等佟世衮去世，他马上行动起来，清洗了佟世衮的势力，杀死了无数人，在消灭敌对派系的同时，也顺便削弱了自己的力量。
然后，皇帝看到，顺派基本要覆灭了，前任的明朝皇帝龟缩在舟山，整个中国，几乎都属于他了。狂妄的年轻人认为自己是世界之王，没有人能够违逆他。于是，他毫不犹豫地揭开了明朝的皮，正式恢复了自己野蛮人的身份，宣布建立新王朝，国号大清。
张无忌建立的大明含义是光明，有着火的属性。佟福临取义大清，不仅有继青帮的含义，更有水的属性，可以克制大明。
这个举措对于他的政治打击是非常严重的，事实上人人都知道他是野蛮人的血统，但是只要他继续保留明朝的装饰，大家还是愿意假装认为他是明朝皇帝而服从他的命令。