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联邦海军重视轻型战舰的战略价值，同时在研发上更加侧重攻击性武器。拥有最优秀的“圣徒”反舰导弹，而相比联盟，联邦的“海百合”系列防空导弹优势不足。
联邦的战列舰采用“全面防护”策略，相较于联盟的“重点防护”，联邦的战列舰具有更加全面的抗击打能力，但是对关键部位的保护不如联盟，这就导致了前期联盟会专门引导炮弹攻击要害部位，联邦一旦处于情报上的劣势，舰队往往就会溃败。
【裂谷级】导弹驱逐舰
联邦舰队防空力量的绝对中坚。携带了大量的防空侦测设备和防空导弹，一艘“裂谷”级甚至搭载了两部粒子束防御系统，当许多艘“裂谷”级编入舰队时，几乎能形成一道无法击破的屏障。由于粒子束防御系统消耗了巨量的能源和等离子体电离舱位，“裂谷”级无法装备粒子束主炮，只能搭载一门150mm电磁轨道炮。
排水量：12000吨
武器搭载：“海百合”防空导弹（200）
“圣徒”反舰导弹（30）
“海百合”反舰型（20）
150mm电磁轨道炮
航速：50kn
最大续航里程：120000海里（聚变反应堆）
【奥兰鹰级】战术驱逐舰
“奥兰鹰”是联邦海军改革前的巡洋舰级，在改革后被用于更先进、优秀的战术驱逐舰。“奥兰鹰”级的反舰火力和防空火力并不能算优秀，甚至连平庸都算不上。但是“奥兰鹰”具有战列舰都无法比拟的超远距离战场感知能力。一艘“奥兰鹰”级可以搜索半径5000海里的所有敌对目标并上传到舰队的火控电脑。
“奥兰鹰”仅仅装备了小型粒子束防御系统，电子设备大量挤占了其舰体空间，导致其主炮无法装载标准粒子束主炮。因此，“奥兰鹰”装备了155mm轨道炮，射速达到了每分钟120发，而且精度极高。虽然155mm轨道炮面对战列舰的重装甲没有什么作用，但是在进行近距离对小型战舰的攻击和对地轰炸上，“奥兰鹰”可是一把好手。
排水量：13000吨
武器搭载：“海百合”反舰型（50）
“海百合”防空导弹（200）
155mm轨道炮
航速：65Kn
最大续航里程：200000海里（聚变反应堆）
【海涛级】攻击型导弹护卫舰
“海涛”级虽然体积小，但是拥有相当高的航速并且可以维持长时间的冲刺。由于舰体被大量导弹武器塞得满满当当，“海涛”级的自身感知能力很弱，通常依靠“奥兰鹰”级提供的共享数据链进行超视距打击。并且“海涛”级装备了实验型超空泡离子鱼雷，细长的舰体搭载着反常的火力，最终让“海涛”级成为了舰队中的刺客。
“海涛”级拥有高引力波隐身能力，并且可以在短时间内释放重力子干扰引力波雷达。它们十分脆弱，舰体一旦遭到破坏有很大几率会引起连锁爆炸。但是“海涛”级装备了一座标准大型粒子束防御系统和标准单联粒子束主炮，足够将任何对它形成威胁的敌对目标彻底摧毁在安全距离外。
排水量：7000吨
武器搭载：“圣徒”反舰导弹（100）
“海百合”防空导弹（250）
单联粒子束主炮
航速：75Kn
最大续航里程：90000海里（聚变反应堆）
【誓言级】重装战列舰
“誓言”级本来是一个完美的作品，但是由于联盟的渗透，导致它漏洞百出。联邦在接连吃亏后，不得不停用所有的“誓言”级。“誓言”级忠诚地采用“全面防护”策略，水下有低阻防雷带，水线有特制的自密性隔离装甲，炮塔和舰桥的装甲厚度达到了800mm。巨大的舰体内置三条弹药组装车间，能够在激烈的战斗中生产弹药并装填进发射管（事后认为这是个愚蠢的设计）。充足的能源和多达200个电离舱位让它有能力驱动12门粒子束主炮，这些威力巨大的主炮在力场稳定器的作用下效率极高，为联邦战争初期拖延了宝贵的时间。
排水量：150000吨
武器搭载：“圣徒”反舰导弹（4000）
“海百合”反舰型（2000）
“海百合”防空导弹（8000）
散播光弹（200）
大型粒子束主炮（12）
超空泡离子鱼雷（150）
战列舰标准副炮组
航速：50Kn
最大续航里程：9500000海里（中子反应堆）
【黑暗边疆级】攻击型强袭战列舰
“黑暗边疆”是联邦海军的备选方案，当“誓言”级被发现拥有致命缺陷时，“黑暗边疆”级立刻开始了建造。由于当初并未入选，“黑暗边疆”级对联盟处于保密状态，而且更新了许多更加先进的战争科技。
“黑暗边疆”级拥有难得的高机动性，较小的转弯半径让它能够做出剧烈的战术机动。同时，“黑暗边疆”级搭载了更大、效率更高的中子反应堆组，能够驱动更加强大的主炮。“黑暗边疆”级吸取教训，安装了五台全方位粒子束防御系统，以及大量常规近防炮。
同时，它还大大强化了侧舷装甲，将低阻防雷带撤去以追求更高的航速和机动性，取而代之的是拦截鱼雷组。保险起见，联邦还给它装上了两组火控雷达，保证在其中一组收到干扰时另一组可以继续运行。侦测设备分为多个小组遍布全舰，避免集成式桅杆受到打击时侦测能力的大幅下降。一切的一切，都是为了向联盟宣告联邦的绝对优势和不被击垮的尊严。
排水量：180000吨
武器搭载：“圣徒”反舰导弹（3000）
“海百合”防空导弹（1200）
“海百合”反舰型（800）
“百灵鸟”防空导弹（2000）
标准大型粒子束主炮（12）
衰变型离子鱼雷
航速：62Kn
最大续航里程：5000000（中子反应堆）
【地狱冥使级】隐身强袭无畏舰
联邦和北方共同体开发的“最终战舰”。这一型号的战舰拥有百分之百的引力波隐形和光学隐身设备。它们行动迅速，火力强大，而防御则相对薄弱。它们最大的敌人是敌军舰队中的护卫舰和驱逐舰，而战列舰则是他们的猎杀目标。
“地狱冥使”级装备了专门针对战列舰的分子崩塌射线炮，这种武器可以直接剥离战列舰的外层装甲。它们的火控雷达无法捕捉驱逐舰、巡洋舰这种小型目标，但是对于战列舰有着独一无二的弱点定位能力，它们不需要部署防空导弹，它们的使命就是彻底摧毁联盟战列舰队。在它们的打击下，任何装甲都将化为虚无，再强大的战列舰也会在神出鬼没的偷袭下沉入海底。
排水量：80000吨
武器搭载：分子崩塌射线炮（1）
粒子束主炮（16）
“圣徒”反舰导弹（300）
“穿刺”隐身反舰导弹（500）
快速打击型战术核弹（100）。
航速：80Kn
最大续航里程：150000海里（中子反应堆）