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贝利亚引起的因帕克危机，光之国的科学家希卡利奥特曼发明了奥特胶囊，里面蕴藏着奥特曼巨大的力量。贝利亚发射了超时空炸弹，毁灭了一个宇宙，自己在爆炸中失去了踪影。使用奥特胶囊的是命运中的一人。
凌天是一名sss级的杀手，在他出生的那一刻，父母被一个杀手杀死了。他恨世间对他的不公平，这种信念迫使他成为杀手。
一天，他来到任务地点，准备执行任务，突然，他感觉头剧烈疼痛，他晕倒了。梦镜里：凌天睁开眼一道光进入他体内，他又感觉到头疼。那道光变成一个巨人。
“你是谁？”
“我是基德奥特曼！”
光完全进入他身体后，一个声音对他说：“凌天，和我一起战斗吧！现在这个宇宙不和平了，会影响到地球的！”
“好！！”
他睁开眼，想，刚才那个是梦吗？……
忽然，地震了一下，一个既像哥莫拉又像雷德王的怪兽，胸前有一个和紫色的彩色计时器。是贝利亚融合兽！
凌天拿出基德升华器。
“那不是梦，是真的！好，做事不能坐以待毙！”
融合！
与我！
携手战斗吧！
融合升华
做好觉悟，上吧！
基～德！
奥特曼贝利亚奥特曼
基德奥特曼原始形态！
一个正义又散发着邪恶气息的巨人出现在骷髅哥莫拉面前。凌天说：“我现在是什么样子？”骷髅哥莫拉怒吼一声，向基德冲去。基德给骷髅哥莫拉一记飞踢，骷髅哥莫拉使出了它的必杀技，基德也使出了必杀，他的眼睛亮起了耀眼的光。
超振动波！
十字冲击波！
两道绝招不相上下，基德加大了输出，骷髅哥莫拉被轰飞了，在空中爆炸了。基德化作了一道光消失了。黑暗中一名男子捡起哥莫拉和雷德王的胶囊，他手里拿着基德升华器。他是不是失踪的贝利亚呢？