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“这界上本没有人病的药，所以才需要医生”——朵丽尔
在白雪覆盖的医疗大国磁鼓岛上，医生们却为国王一条荒唐的驱逐令，纷纷逃离了国家，除了国王控制起来的二十名医生之，岛上有两名留守在国内的医生。一个是有着“上医医国”却本不会病的庸医，希鲁鲁克，而另一个则是医术高超却脾气古怪的魔女医生朵丽尔。
已经一三十岁的朵丽尔除了面容有衰老，年靠着高超的医术修复身体，而身体却像年轻人一样健康。为老而不死且费昂贵脾气古怪国民称为魔女。而庸医希鲁鲁克则是在这个国家唯一的朋友。
得自己绝症复发，剩下几时间，决定以死的庸医希鲁鲁克，在临行将自己靠抢富人的钱研究了30年的成，给了朵丽尔。已经病入膏肓时日无多的他，跪倒在朵丽尔面能在自己死后照顾自己养的一头小驯鹿，让教乔巴医术，而且坚信乔巴会成为优秀的医生。却朵丽尔拒绝了。
孤身一人往城堡去拯救二十名医生的希鲁鲁克，中了一个圈套，在国王的围剿中，含笑饮下了含有炸弹的酒。希鲁鲁克死了，悲痛万分的小乔巴找到了朵丽尔，他含泪挥舞着庸医生留下的贼旗，哀嚎着朵丽尔将医术传授给他，让自己成为能医何病症的医生。当时已经拒绝了庸医请的朵丽尔，终还是将这个名叫乔巴的小家伙带了家。从开始，这个年独居的孤寡老人，生中也多了一个单纯乖巧的小跟班。
乔巴是个敏感的小朋友，刚出生就为与众不同的蓝鼻子鹿群排斥，他总是一个人孤零零的走在入群的后面。后来又为无中误食了人人实的他，更是鹿群和人类视为怪物，处驱赶，过上了东躲藏的日子。不容易遇到了把自己当成亲儿子的庸医，如今却是阴阳隔。这个内心已经千疮孔的自卑小家伙，让朵丽儿觉得十分心疼，刀子嘴豆腐心的，也将自己一多年所掌握的全部医术，都毫不留的悉数教给了这个继承了庸医“救医心”的小家伙。
一伙名为黑胡子的贼团突袭了磁鼓岛，胆小的国王一时间抛弃了子民，跑到了上。在这伙贼走后，磁鼓岛终于迎来了久违且短暂的和。朵丽尔也带着乔巴搬进了高耸入云的磁鼓岛城堡中。乔巴将希鲁鲁克的樱花贼旗插在了城堡顶，一希鲁鲁克误导的乔巴始终认为贼是群了不起的人，而贼旗上的骷髅标则着不屈的信念。在一趋于静的日子里小乔巴，每都在用心学习着医术。而朵丽尔在教导乔巴的同时，也在完成着庸医个在起来有点傻的伟大梦。他将希鲁鲁克研究了三十年的粉红色粉末逐步批量生产。
这另一会儿贼的到来，打破了磁鼓岛久违的宁静。这个浑身严冻伤的草帽小子，背着两个垂危的同伴，徒手爬上了几千米的雪山。见到了朵丽尔后这个已经奄奄一息的年轻人说了一句：“他们是我同伴啊…”之后便昏死了过去。
今的城堡里格的热闹，获救苏醒的贼们把乔巴判定为可食用的素材，于是在城堡里追逐了起来。在得乔巴就是救了他们的医生之后，带草帽的小子萌生了拉他上船的念头。慌忙逃窜到城堡的桥堡，却发现了一群不速之客。磁鼓岛的国王拉着几架巨炮，带着一行人从上来了，来到城堡发现鸠占鹊巢的暴君，生气地将炮火对准了屋顶的贼旗，一声炮响之后，屋顶面着希鲁鲁克信念的贼旗变得摇摇欲坠。而下一刻却跃上屋顶的草帽小子一把抓住，感觉到了挑衅的国王轰出了二发炮弹，避无可避的草帽小子持着举旗姿势，面击中了。在众人的惊呼中，鼻子已经渗出鲜血的草帽小子，仍举旗而立，他着炮火的方大喊：“这可不是种傻不拉叽笑呵呵的人能够折断的旗子！”他的声音响彻了磁鼓岛。时站在雪地中的朵丽尔望着，眼震撼到无以复加的乔巴，心里面也隐隐有了一决议。
归来，打算将含有病毒的炮弹轰空中，将所有国民毒死，后再立过国家的疯子国王。经过一番激战后，终草帽贼团和乔巴联手打败。准备再出行的草帽小子一伙，要在临行邀请乔巴上船。自卑心理作祟的乔巴，扭捏着来到了一行人面。“我不是人类的同伴啊，又是一个怪物我是无法成为们的同伴的啊，如们愿的话就再来到这里…”言不衷的，他一说着自己的缺点和委婉拒绝的话。却草帽小子粗暴的打断了，“少啰嗦，走啦！”乔巴也草帽小子的诚所打动。
下定决心的小乔巴鼓足勇气去跟朵丽尔告，却是朵丽尔要去帮忙搬运炮车。乔巴还在继续诉说着自己的法，却朵丽尔怒吼着拒绝了他的请。“我从来没有听说过区区驯鹿要出去的，这样的爱哭鬼还自称是男子汉？我绝不允许妄为”面对恶狠狠，甩出无数把飞刀的朵丽尔医娘。把心一横的小驯鹿用快的速度城堡的方跑去。无数把飞刀贴着他的身边飞过，却一把都没有伤到他。望载着一群贼着远方，渐行渐远的乔巴。苦肉计得逞的朵丽儿，嘴里喃喃的说：“我讨厌哭，分的时候哭哭啼啼的，出航时一定要气势磅礴！”朵丽尔转身旁搬运炮车的人。“准备了吗？小伙子们，开炮！”。
一声声的炮响，响彻了磁鼓岛的夜空。已经跑远了，乔巴转头城堡的方望去，刻映入他眼中的是颗希鲁鲁克梦中，绽在雪国的奇迹樱花树（粉红色的粉末附着在大气中的白雪上，就会飘起鲜艳华丽的粉红色的雪）。乔巴望着奇迹樱花树声大哭。
“了，上吧，笨儿子”