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鞠文泰死后，鞠智盛继，他致书给侯君集说“王对可汗无礼，自己刚刚继没什过错，希望能手下留。”侯君集示，如真心悔过，就开城投降。鞠智盛未出降，侯君集令大军继续攻城，战车投石车同时发动，城内乱成一团，大纷纷躲到屋内。
鞠智盛还在真的等待着突厥的支援，突厥听说侯君集大军到来，早就逃到千里之了。鞠智盛无计可施，能投降。
侯君集分高昌地，高昌国灭亡，侯君集俘虏鞠智盛和余百官，刻石记功班师朝。
侯君集在攻灭高昌国后，在没有请示李世民的况下，私自发配高昌臣民，将高昌国宝据为己有。上行下效，将士们也纷纷抢夺金银珠宝，侯君集也不敢。
班师后，司法部门将侯君集下狱，大臣们认为侯君集是功臣大将，不能侮辱，于是上书李世民将他释。侯君集自以为立下大功却犯了点小错误而囚禁感到不快，这也导致了后他太子策参与谋，下再讲。
高昌灭了，难保后不再出现问，为了彻底决域问，李世民和大臣们开始商议，大议在域设立行构，派驻官员进行长驻守。也有人不同，说大唐对待夷的策一就是以夷夷，尊当地的生习惯，与之共存，况且驻军域开销极大且鞭长莫，得不偿失。李世民再三考虑后，决定在高昌国设立安护府掌域国。。
贞观十六年，在设立安护府的三年，安护郭孝恪曾连续击败突厥乙毗咄陆可汗。再上乙毗咄陆可汗长年对征战，他的部下分崩离析，乙毗咄陆可汗曾派人招他的部下首领，却绝:“即我们这里战死至一人，也不会再跟了。”乙毗咄陆可汗郁郁而终。部下首领请李世民再立的突厥可汗，李世民册立乙毗射匮可汗。贞观二十年，乙毗射匮可汗遣入朝纳贡，请婚。（之后，突厥再叛，至高宗李治时才唐大将苏定方攻灭）
安护府的设立具有跨时的义，他一共存在大概二百年，在处域务上发挥极为要的作用。后，唐朝安史之乱无暇顾，安护府几经易手，吐蕃鹘数十万大军围城，名将郭昕率领安军拼死抵抗。时的朝廷早已没有能力支援，他们甚至认为域地区早已沦陷，守城的安军经过半个世纪的抵抗，一个个已从气风发的青少年变成了白发苍苍的老头，要听到战鼓响，一个个披坚持锐、拼死杀敌。为大唐后的荣耀，粮食没了就吃战马。书写了一部安独守大唐魂的壮歌。