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嘉靖四十五年十二月十四日，嘉靖帝驾崩于乾清宫，年60岁。天下缟素，内阁之中首辅徐阶，礼部尚书高拱和张居正等人商量着新皇登基。徐阶作为领头率先开口：“今皇上驾崩，却未立储君，当遵循礼制由裕王继位。”其余众人纷纷点头同意，裕王待人宽容，用人不疑，对他们来说是一个合格的皇帝。
这些被压制的大臣不需要再来一个像嘉靖一样强势的皇帝，他们或多或少都与裕王有所交集，裕王登基之后必定会用他们，真是再合适不过的皇帝人选。
内阁的会议结束之后，徐阶留下了张居正，徐阶对着张居正道：“今日在内阁的人都将是未来几年大明权力巅峰的几个人，我今日留你起草先皇遗诏，准备将大礼议中因反对世宗皇帝而获罪的大臣全部平反并加以任用，让他们心存感激。”
“学生明白。”张居正走到案前，与徐阶开始起草“遗诏”。
“遗诏”在两人的商量中完成了，两人在遗诏中强调了世宗皇帝对痴迷道教的错误有所反省，为那些因批评皇帝而遭到惩处的官员恢复名誉和官职，惩处主持玄修的道士，并停止一切斋醮活动。
韩锋手上拿着一份遗诏的抄录正看的津津有味，：“啧啧啧，不愧是两位大学士，文采斐然啊。看这遗诏，将嘉靖写得仿若一位圣明之君，以皇帝之名施恩众臣，朝堂之上还有几人能与这师生二人相抗衡。”（接下来，韩锋改称朱翊钧）
一切如同朱翊钧预料的那样，遗诏一发布许多大臣感激涕零，徐阶凭借自己在朝中这么多年的声望成了诸臣之首。
十二月二十六日，穆宗皇帝即位，由礼部的官员分别到天坛、先农坛、太庙告知祖先。身着黄色衮服的皇帝登上天安门城楼后，登基仪式正式开始。文武百官身着朝服，在「洪胪寺」官员的引导下，经过金水桥进入紫禁城。皇上从天安门城楼上下来后，进入「奉天殿」就座。
大臣们依照官阶高低鱼贯进入，对穆宗皇帝上表道贺。司礼太监上前宣读诏书：“今日朕即位天子，改元“隆庆”。”
在诏书中朱载垕为了纠正嘉靖的施政弊端对因进言嘉靖获罪的诸臣全部召用，已死之臣抚恤并录用其后。坐在龙椅之上：“传朕旨意，将王今、刘文斌等为先皇炼药的方士全部押到有司论罪，全国的道教仪式全部停止，免除今年一半田赋及嘉靖四十三年以前的所有欠赋。”。
诸位大臣皆拜：“皇上圣明，吾皇万岁万岁万万岁。”
登基之后第一次上朝基本没人会启奏事情，早早便下朝。