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咸丰朝
纪年军机大臣
元年祁寯藻、赛尚阿、何汝霖、季芝昌（五月改闽浙总督）、穆荫（三月学习入直）
舒兴阿（四月入直，闰八月署陕甘总督）、彭蕴章（五月入直）
二年赛尚阿（九月革）、祁寯藻、何汝霖（三月罢直）、彭蕴章、穆荫（学习）
邵灿（五月入直）、麟魁（五月入直）
三年祁寯藻、麟魁（十月罢直）、彭蕴章、邵灿（十二月改漕运总督）、穆荫（十月入直）
恭亲王奕（十月入直）、瑞麟（十月入直）、杜翰（十二月入直）
四年恭亲王奕、祁寯藻（十一月休）、彭蕴章、瑞麟、杜翰、穆荫
五年恭亲王奕（七月罢直）、彭蕴章、穆荫、瑞麟（四月改西安将军）、杜翰、文庆（七月入直）
六年文庆（十一月死）、彭蕴章、穆荫、杜翰、柏葰（十一月入直）
七年彭蕴章、柏葰、穆荫、杜翰
八年彭蕴章、柏葰（十月革）、穆荫、杜翰（五月忧免）、匡源（五月学习入直）、文祥（五月学习入直）
九年彭蕴章、穆荫、匡源（十月入直）、文祥（十月入直）、杜翰（十月入直）
十年彭蕴章（六月罢直）、穆荫、匡源、文祥、杜翰、焦佑瀛（十月学习入直）
十一年穆荫、匡源、杜翰、焦佑瀛（学习）
（上列四人七月随怡亲王载垣等同称赞襄政务大臣，九月俱革职）、文祥
恭亲王奕、桂良、沈兆霖、宝鋆、曹毓英（左列五人俱十月入直）
同治朝
纪年军机大臣
元年恭亲王奕、桂良（六月死）、沈兆霖（五月署陕甘总督）、宝鋆
文祥、曹毓瑛（十月入直）、李棠阶（闰八月入直）
二年恭亲王奕、文祥、宝鋆、李棠阶、曹毓瑛
三年恭亲王奕、文祥、宝鋆、李棠阶、曹毓瑛
四年恭亲王奕（三月罢直，四月复入直）、文祥、宝鋆、李棠阶（十一月死）
曹毓瑛、李鸿藻（十一月学习入直）
五年恭亲王奕、文祥、宝鋆、曹毓瑛（三月死）、李鸿藻（三月正式入直，七月忧免）
胡家玉（三月学习入直，十二月罢直）、汪元方（十月入直）
六年恭亲王奕、文祥、宝鋆、汪元方（十月死）、沈桂芬（十月学习入直）
七年恭亲王奕、文祥、宝鋆、沈桂芬（三月正式入直）、李鸿藻（服阙十月入直）
八年恭亲王奕、文祥、宝鋆、沈桂芬、李鸿藻
九年恭亲王奕、文祥、宝鋆、沈桂芬、李鸿藻
十年恭亲王奕、文祥、宝鋆、沈桂芬、李鸿藻
十一年恭亲王奕、文祥、宝鋆、沈桂芬、李鸿藻
十二年恭亲王奕、文祥、宝鋆、沈桂芬、李鸿藻
十三年恭亲王奕、文祥、宝鋆、沈桂芬、李鸿藻
光绪朝
纪年军机大臣
元年恭亲王奕、文祥、宝鋆、沈桂芬、李鸿藻
二年恭亲王奕、文祥（五月死）、宝鋆、沈桂芬、李鸿藻、景廉（三月学习入直）
三年恭亲王奕、宝鋆、沈桂芬、李鸿藻（九月忧免）、景廉（正月正式入直）
四年恭亲王奕、宝鋆、沈桂芬、景廉、王文韶（二月学习入直）
五年恭亲王奕、宝鋆、沈桂芬、景廉、王文韶（正月正式入直）
六年恭亲王奕、宝鋆、沈桂芬、景廉、王文韶、李鸿藻（正月服阙入直）
七年恭亲王奕、宝鋆、沈桂芬（正月死）、李鸿藻、景廉、王文韶、左宗棠（正月入直九月授两江总督）
八年恭亲王奕、宝鋆、李鸿藻、景廉、王文韶（十一月乞养）
翁同和（十一月入直）、潘祖荫（十一月入直）
九年恭亲王奕、宝鋆、李鸿藻、景廉（六月降调，十一月复入直）、翁同和、潘祖荫（正月忧免）
十年恭亲王奕（三月罢直）、宝鋆（三月休）、李鸿藻（三月降调）
景廉（三月降调）、翁同和（三月罢直）、礼亲王世铎（三月入直）、额勒和布（三月入直）
阎敬铭（三月入直）、张之万（三月入直）、孙毓汶（三月学习入直）
许庚身（三月学习入直，八月正式入直）、左宗棠（五月入直，七月督办闵军）
十一年礼亲王世铎、额勒和布、阎敬铭、张之万、许庚身、孙毓汶（六月正式入直）
十二年礼亲王世铎、额勒和布、阎敬铭（九月罢直）、张之万、许庚身、孙毓汶
十三年礼亲王世铎、额勒和布、张之万、许庚身、孙毓汶
十四年礼亲王世铎、额勒和布、张之万、许庚身、孙毓汶
十五年礼亲王世铎、额勒和布、张之万、许庚身、孙毓汶
十六年礼亲王世铎、额勒和布、张之万、许庚身、孙毓汶
十七年礼亲王世铎、额勒和布、张之万、许庚身、孙毓汶
十八年礼亲王世铎、额勒和布、张之万、许庚身、孙毓汶
十九年礼亲王世铎、额勒和布、张之万、许庚身（十二月死）、孙毓汶、徐用仪（十二月学习入直）
二十年礼亲王世铎、额勒和布（十月罢直）、张之万（十月罢直）、孙毓汶、徐用仪（六月正式入直）
翁同和（十月入直）、李鸿藻（十月入直）、刚毅（十月入直）、恭亲王奕（十一月入直）
二十一年恭亲王奕、礼亲王世铎、孙毓汶（六月病免）、翁同和、李鸿藻、徐用仪（六月罢直）
刚毅、钱应溥（六月入直）
二十二年恭亲王奕、礼亲王世铎、翁同和、李鸿藻、刚毅、钱应溥
二十三年恭亲王奕、礼亲王世铎、翁同和、李鸿藻（七月死）、刚毅、钱应溥
二十四年恭亲王奕（四月死）、礼亲王世铎、翁同和（四月罢直）、刚毅、钱应溥
廖寿恒（二月学习入直）、王文韶（五月入直）、裕禄（五月入直，八月改直隶总督）
荣禄（八月入直）、启秀（十一月入直）
二十五年礼亲王世铎、荣禄、刚毅、王文韶、钱应溥（五月病免）、启秀、廖寿恒（学习，十一月罢直）
赵舒翘（十一月学习入直）
二十六年礼亲王世铎、荣禄、刚毅（九月革）、王文韶、启秀（十二月革）、赵舒翘（学习，九月革）
端郡王载漪（八月入直，闰八月罢直）、鹿传霖（闰八月入直）
二十七年礼亲王世铎（七月罢直）、荣禄、王文韶、鹿传霖、瞿鸿机（四月学习入直，十二月正式入直）
二十八年荣禄、王文韶、鹿传霖、瞿鸿机
二十九年荣禄（三月死）、王文韶、鹿传霖、瞿鸿机、******奕劻（三月入直）
荣庆（九月学习入直，十二月正式入直）
三十年******奕劻、王文韶、鹿传霖、瞿鸿机、荣庆
三十一年******奕劻、王文韶（五月罢直）、鹿传霖、瞿鸿机、荣庆
徐世昌（五月学习入直，十二月正式入直）、铁良（七月学习入直，十二月正式入直）
三十二年******奕劻、鹿传霖（九月罢直）、瞿鸿机、荣庆（九月罢直）、铁良（九月罢直）
徐世昌（九月罢直）、世续（九月入直）、林绍年（九月学习入直）
三十三年******奕劻、世续、瞿鸿机（五月解）、林绍年（学习，七月改河南巡抚）、鹿传霖（五月任）
醇亲王载沣（五月学习入直）、张之洞（七月入直）、袁世凯（七月入直）
三十四年******奕劻、醇亲王载沣（正月正式入直，十月罢直）、世续、张之洞、鹿传霖
袁世凯（十二月免）、那桐（十二月学习入直）
宣统朝
纪年军机大臣
元年******奕劻、世续、张之洞（八月死）、那桐（正月正式入直）、鹿传霖、戴鸿慈（八月学习入直）
二年******奕劻、世续（七月罢直）、那桐、鹿传霖（七月死）、戴鸿慈（正月正式入直
吴郁生（正月学习入直，七月罢直）、贝勒毓朗（七月入直）、徐世昌（七月入直）
三年******奕劻、贝勒毓朗、那桐、徐世昌
是年四月戊寅（1911年5月8日）裁撤军机处。